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2023 — Characterization of anti-gp120/Env-specific antibody functionality in HIV controllers associated with HIV controlRésumé
La thérapie antirétrovirale (ART) contrôle efficacement la réplication du virus de l’immunodéficience humaine (VIH) mais ne guérit pas l’infection. Le seul essai vaccinal ayant montré une protection partielle contre l’infection, le RV144, a mis en évidence le rôle des anticorps (Ac) antiviraux dans cette protection. Les Ac font le lien entre la glycoprotéine 120 (gp120) ou l’enveloppe (Env) virale à la surface des cellules infectées et les récepteurs Fc (FcR) à la surface des cellules du système immunitaire inné. La liaison des Ac aux FcR va stimuler la phagocytose et le trogocytose par les monocytes, la lyse des cellules cibles … Lire la suite
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2011 — Determination of formaldehyde in ambient air using on-fibre derivatization with solid phase microextraction (SPME)Résumé
Le formaldéhyde joue un rôle important en tant qu'intermédiaire dans l'oxydation du méthane dans la phase gazeuse ainsi que dans les réactions chimiques de la troposphère en influençant le budget de radicaux hydroxyle et donc la capacité oxydative de l'atmosphère. Afin d'évaluer l'influence du formaldéhyde sur les cycles atmosphériques, la concentration atmosphérique exacte est requise et ce nécessite une méthodologie précise pour prendre des mesures. Dans ce travail la concentration du formaldéhyde dans l'atmosphère non polluée est mesurée à l'aide d'une fibre de micro extraction phase solide (SPME). Cette méthode consiste à dérivatiser le formaldéhyde en son oxime de pentafluorobenzyl … Lire la suite
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2015 — Improving physical methods of cell permeabilization by reducing plasma membrane stiffness in HeLa cellsRésumé
Lorsque des forces mécaniques sont appliquées sur une cellule, un transfert de gènes peut s’effectuer amenant à une perméabilité de la membrane sur un temps limité. C’est ainsi que l’acide nucléique ou autres macromolécules peuvent pénétrer l’entité cellulaire dans le cadre d’une thérapie génique. Un transport moléculaire naturel ne pourrait pas s’effectuer sans aide additionnelle extérieure.La perméabilité de la cellule peut être contrôlée par plusieurs paramètres, notamment le temps de l’opération, la fréquence et l’amplitude de la force appliquée. Cette dernière est déterminée grâce à la connaissance du comportement viscoélastique et non-linéaire de la membrane. Les propriétés mécaniques jouent donc … Lire la suite
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2012 — Redefining postmenopausal dyspareunia: Critical review, description, and biopsychosocial correlates of an understudied pain disorderRésumé
La dyspareunie (douleurs ressenties au cours des rapports sexuels) est très répandue chez les femmes post-ménopausées et constitue l'une des principales plaintes formulées par les femmes dans les cliniques de la ménopause. La dyspareunie post-ménopausique a traditionnellement été attribuée presque exclusivement à la baisse des niveaux d'oestrogènes endogènes et l'atrophie vulvo-vaginale qui en résulte. Ce point de vue prédomine encore aujourd'hui malgré l'absence de preuve permettant de l'établir de façon concluante. Le premier chapitre de cette thèse analyse de façon critique la littérature portant sur la dyspareunie post-ménopausique, examinant la conceptualisation largement répandue selon laquelle la dyspareunie post- ménopausique est … Lire la suite
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2012 — Bayesian modeling of continuous diagnostic test data: sample size and Polya treesRésumé
Les modèles paramétriques tel que le modèle binormal ont été largement utilisés pour analyser les données provenant de tests de diagnostic continus et non parfaits. De tels modèles reposent sur des suppositions souvent non réalistes et/ou non verifiables, et dans de tels cas les modèles nonparamétriques représentent une alternative attrayante. De plus, même quand la supposition de normalité est rencontrée les chercheurs ont tendence à sous-estimer la taille d'échantillon requise pour estimer avec exactitude la prédominance d'une maladie à partir de ces modèles bi-normaux quand les densités associées aux sujets malades se chevauchent avec celles associées aux sujets non malades. … Lire la suite
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2020 — Illuminating the replisome, one molecule at a timeRésumé
La réplication de l’ADN est un évènement crucial dans la vie d’une cellule. La machinerie cellulaire responsable de la réplication de l’ADN est composée d’un complexe de plusieurs protéines, mieux connu sous le nom du réplisome. Le réplisome a besoin de répliquer l’ADN de manière efficace, et aussi d’assurer une intégrité génomique de grande qualité, puisque des erreurs de réplication peuvent mener à des mutations et potentiellement à la mort cellulaire ou bien le cancer. Une question importante est : Est-ce que les réplisomes de différents organismes partagent des fonctions et des structures similaires entre eux, même dans les cas … Lire la suite
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2009 — Optimization algorithms for minor-closed classes of graphsRésumé
Une classe de graphes est dite close par mineur si elle contient tous les mineurs de ses éléments. Dans cette thèse, nous discutons des algorithmes d'optimisation pour certaines classes closes par mineur qui exploitent leur structure. Ces algorithmes sont basés sur des décompositions arborescentes spéciales de ces graphes et quelques autres théorèmes structurels. Nous présentons de nouveaux résultats sur la recherche de couvertures de cycles impairs de taille limitée. Nous présentons un nouvel algorithme pour résoudre ce problème dans un graphe arbitraire, et montrons qu'une variante de cet algorithme prend un temps linéaire sur la classe de graphes obtenus en … Lire la suite
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2011 — Measurement of exercise cardiac output in chronic obstructive pulmonary disease: comparison of three non-invasive techniquesRésumé
La mesure du débit cardiaque (Qc) à l'effort chez les patients MPOC est limitée par la disponibilité des techniques non-invasives valides et fiables qui parviennent à détourner les anomalies de ventilation-perfusion. Cette étude a comparé trois techniques, dont deux sont basées sur la diffusion pulmonaire (respiration en circuit fermé de CO2 et de gas inerte avec l'Innocor ® et l'autre utilise l'impédancemetrie thoracique (Physioflow®), afin de déterminer le Qc chez 13 patients MPOC (GOLD II-III) et 11 participants contrôles (CTRL) du même âge. Les mesures ont été obtenues sur ergocycle à 20, 35 et 50% de la puissance maximale. Le … Lire la suite
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2015 — Novel mechanisms and interventions addressing locomotor muscle atrophy and reduced oxidative capacity in severe COPD patients.Résumé
La maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) est la 4eme cause de décès à travers le monde. Cette maladie, pour laquelle il n’existe aucune cure, représente un très grand fardeau économique. La MPOC est caractérisée par une réduction de la capacité respiratoire, une intolérance à l’exercice et des dysfonctions musculaires. Il est bien reconnu que l’atrophie musculaire, qui affecte un quart des patients, ainsi que la réduction de la capacité oxydative, sont des aspects important de cette pathologie. Cependant, les mécanismes causant ces altérations musculaires demeurent largement méconnus et la possibilité de renverser ces altérations reste incertaine. La première partie de … Lire la suite
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2005 — Identification and characterization of factors binding to the CS3 Element of the mouse Foxa2 node enhancerRésumé
Chez la souris, l'établissement du patron embryonnaire est étroitement lié à la spécification du nœud, une structure équivalente a l’organisateur chez les amphibiens. Même s'il est clair que le facteur de transcription Foxa2 est requis pour la formation du nœud, la cascade transcriptionnelle conduisant à son expression dans cette structure sont encore inconnus. Il a été démontré qu'une séquence de 500 paires de bases contenue dans la région enfance de Foxa2 pouvait induire son expression dans le nœud. Cette séquence enhancer contient trois régions conservées chez les vertèbres: CS1, CS2 et CS3. La région CS3 a été identifiée comme étant … Lire la suite
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2018 — Small-molecule modulation of 14-3-3 adaptor proteins for axon regenerationRésumé
Les axones sont des projections cellulaires qui relient les neurones dans des circuits fonctionnels sur de longues distances. Les réseaux d’axones dans la moelle épinière transmettent des informations motrices et sensorielles entre le cerveau et le corps. Traumatisme de la moelle épinière provoque des dommages axonaux et perturbe cette communication. Les axones endommagés dans le système nerveux central (SNC) ne se régénèrent pas spontanément et ne se reconnectent pas à leurs cibles. Ce problème fondamental est la cause directe de la paralysie permanente et de la perte sensorielle chez les patients atteints d'une lésion de la moelle épinière. Les médicaments … Lire la suite
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2015 — At home with Barber: Vanessa and the queer 1950sRésumé
Malgré la croissance continue de la musicologie queer, le compositeur Samuel Barber demeure fortement absent dans la littérature sur la vie musicale des gais Américains. Quoique Barber soit populaire parmi les publics, les analyses théoriques à son sujet se sont fait limitées du fait de l'estimation de son conservatisme. Le présent projet de recherche enrichira les écrits de Barber en reconsidérant sa sensibilité Romantique dans le contexte de sa sexualité, révélant un dévouement au monde domestique qui aurait su frustrer les descriptions antécédentes de l'esthétique queer moderniste du milieu du vingtième siècle. Le premier opéra de Barber, Vanessa (1958), dont … Lire la suite
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2017 — Characterizing recent intron gain events in «Arabidopsis lyrata» using phylogenetic inferenceRésumé
Alors que les mécanismes de délétion des introns sont bien documentés, la façon dont les introns sont créés est moins connue. Pour ce projet de recherche, une méthode bio-informatique a été développée pour trouver les introns récents afin de caractériser les méchanisms menant à leur création. Les annotations des gènes d'Arabidopsis lyrata ont été comparées au génome d'Arabidopsis thaliana, ensuite une analyse phylogénétique visant à confirmer le gain plutôt que la perte de l'intron a été utilisée. En examinant les séquences, il a été possible de décrire des mécanismes biologiques par lequel les éléments transposables s'insèrent dans les gènes fonctionnels … Lire la suite
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2014 — The effect of grain refinement on the oxidation performance of MCrAlY alloysRésumé
La famille des alliages de MCrAlY est une classe de super-alliages à base de nickel principalement utilisés en tant que revêtement thermiquement isolant ou afin d'augmenter la résistance à l'oxydation. Cette thèse portera principalement sur l'étude de l'amélioration de l'oxydation à haute température et du comportement en corrosion du MCrAlY et de ses alliages par l'étude de leur nanostructure en développant la compréhension des mécanismes d'oxydation des matériaux à structure de grains raffinée jusqu'à l'évaluation de leur performance en environnement simulé. Il a été démontré que l'affinement de la structure des grains favorise la formation d'une couche d'oxyde simple d'alumine … Lire la suite
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2010 — Point-based POMDP solvers: Survey and comparative analysisRésumé
L'importance grandissante de la recherche dans le domaine de la planification sous incertitude est signe que l'élaboration d'algorithmes robustes et extensibles qui gèrent l'incertitude est un élément clé dans le développement de systèmes autonomes et semi-autonomes efficaces. Les processus de décision markoviens partiellement observables (POMDP) constituent une puissante fondation mathématique pour le choix d'actions optimales dans un environnement incertain. Il a cependant été difficile d'incorporer les POMDPs à des applications réelles, à cause de leur coût de calcul élevé lorsqu'une solution exacte est requise. Récemment, les approches de résolution de POMDPs dites par points, qui planifient sur un petit sous-ensemble … Lire la suite
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2013 — Nutritional and functional properties of popped little millet («Panicum sumatrense»)Résumé
L'industrie alimentaire vise le développement d'aliments et d'ingrédients fonctionnels. De nombreux grains anciens sont utilisés comme source d'éléments nutritifs fonctionnels. Le millet est une petite graminée qui possède une excellente valeur nutritive, sans gluten et facilement digestible. Cependant cette céréale est peu consommée. Cela s'explique en partie par la non-disponibilité de produits prêts à manger issus du millet. La transformation du millet afin de l'incorporer dans une variété d'aliments peut améliorer sa valeur nutritive, sa disponibilité et sa valeur économique. Les traitements thermiques peuvent améliorer la biodisponibilité de certaines vitamines et minéraux et peuvent aider également a diminué l'activité de … Lire la suite
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2010 — The identification of genes regulated by Interferon Regulatory Factors (IRF) 1 and 8 in the context of pathogen challenge by ChIP on Chip and genome wide transcription profiling approachesRésumé
Les facteurs régulateurs interférons (IRFs) sont une famille de régulateurs transcriptionnels essentiels à la différenciation et la croissance cellulaire, à l'oncogénèse et au bon maintien du système immunitaire. IRF1 et IRF8 jouent un role clé dans l'immunité de l'organisme par la régulation de la différenciation des lignées cellulaires myéloïdes, nottament le développement de cellules immunitaires comme les macrophages, les cellules tueuses naturelles (NK) et les cellules dendritiques. Ces deux facteurs de transcription sont indispensables pour la résistance aux infections virales et bactériennes. Nous avons optimisé une technique d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) afin d'y utiliser des anticorps ciblant IRF1 et … Lire la suite
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1987 — Neural Tube Defects in the Mouse: Interactions between the Splotch Gene and Retinoic AcidRésumé
Deux sortes d’interactions entre la mutation splotch (sp) et l'acide rétinoïque (AR), l'une additive et l'autre négative, influencent le développement du tube neural chez la souris. Les embryons sp/+, marques cytogénétiquement, ont une fermeture du tube neural plus lente que celle des embryons +/+. L'anomalie fondamentale, comme elle a été observé chez les sp homozygotiques, est reliée à une modification de la matrice extracellulaire. L'AR retarde aussi la fermeture du tube neural, quand les embryons y sont exposés in vitro au 8e jour de gestation, apparemment en désorganisant la forme normale du tube neural. Les effets de sp et AR … Lire la suite
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2021 — Synthesis of novel chloroquine derivatives and insights into the interactions of a resistance proteinRésumé
Le bilan humain causé par le paludisme reste dévastateur. Rien qu'en 2018, il y a eu 228 millions de cas, entraînant 405000 décès. Le paludisme est causé par le parasite Plasmodium transmis par le moustique Anopheles. Il existe 5 espèces: P. malariae, P. falciparum, P. vivax, P. ovale et P. knowlesi, dans lesquelles P. falciparum est le plus commun et le plus mortel. Un médicament antipaludique appelé chloroquine a été introduit pour la première fois dans les années 1940 et est considéré comme le médicament antipaludique de référence en raison de sa haute efficacité, son faible coût et sa faible … Lire la suite
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2022 — Intrinsically disordered sequences in the Polycomb protein Polyhomeotic regulate condensate formationRésumé
Au sein des noyaux cellulaires, le complexe Polycomb PRC1 forme des structures condensées appelées corps Polycomb. Parmi les sous-unités de PRC1, Polyhomeotic (Ph) contient le domaine « sterile alpha motif » (SAM) qui est capable de se polymériser et est impliqué dans la formation des corps Polycomb et l’organisation de la chromatine chez de nombreux organismes tels que la Drosophile et les mammifères. La séparation de phase liquide-liquide est de plus en plus considérée comme mécanisme conduisant à la formation de condensats de protéines et d’acides nucléiques, notamment lors de l’organisation de la chromatine. Une version tronquée de Ph, appelée … Lire la suite