Inventaire ichtyologique du bassin versant de la zone du Chêne et de la forêt de la Seigneurie de Lotbinière au moyen de l’ADN environnemental

Résumé

L’inventaire ichtyologique sur le territoire de l’Organisme de bassins versants (OBV) de la zone du Chêne et de la forêt de la Seigneurie de Lotbinière (FSL) a été réalisé par l’analyse de l’ADN environnemental (ADNe). Le but principal consiste à documenter la diversité et l’abondance relative des poissons dans plusieurs sites de la FSL ainsi qu’en territoire agroforestier, et de comparer la richesse spécifique détectée par l’ADNe à celle obtenue lors d’inventaires antérieurs. Quarante et une espèces de poissons sont présentes sur le territoire, dont l’omble de fontaine (Salvelinus fontinalis) et l’achigan à petite bouche (Micropterus dolomieu) recherchés par les pêcheurs, ainsi que deux espèces d’un intérêt particulier pour la conservation, le fouille-roche gris (Percina copelandi) et le méné bec-de-lièvre (Exoglossum maxillingua). Quatre espèces y sont répertoriées pour la première fois. Lorsque la capture de poissons n’est pas nécessaire, l’ADNe est une technique très efficace qui permet de brosser un portrait plus complet des espèces en présence avec un effort d’échantillonnage moindre que les techniques d’inventaires traditionnels, et ce, de manière beaucoup moins invasive.

Mots-clés :

• ADNe,
• conservation,
• inventaire ichtyologique,
• poisson,
• rivière

Abstract

An analysis of environmental DNA (eDNA) was used to document the fish community in the watershed managed by the Organisme de bassin versant de la zone du Chêne and in the Forêt de la Seigneurie de Lotbinière (FSL) (Québec, Canada). The main goal was to document species diversity and relative abundance at different sites within the FSL and in the adjacent agroforestry landscape, and to compare the species richness detected by eDNA with that obtained during previous traditional inventories. Forty-one species of fish were detected, including 2 species sought after by anglers, the brook charr (Salvelinus fontinalis) and smallmouth bass (Micropterus dolomieu), and 2 species of particular conservation interest, the channel darter (Percina copelandi) and cutlip minnow (Exoglossum maxillingua). Four species were new records for the watershed. When fish do not need to be caught, eDNA sampling offers a highly effective and much less invasive means of obtaining a detailed picture of the species present. Furthermore, it requires a lower sampling effort than traditional survey techniques.

Keywords:

• conservation,
• eDNA,
• fish,
• river,
• survey