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2018 — Detection of errors in multiple genome alignments using machine learning approachesAbstract
L'alignement multiple des séquences est une condition préalable à la plupart des analyses évolutives et phylogénétiques. Des travaux antérieurs ont montré que les algorithmes d'alignement existants ne sont pas parfaitement précis et il est donc important d'identifier les régions suspectes dans les alignements du génome entier. Dans cette thése, nous développons un modèle d'apprentissage automatique capable de détecter les erreurs dans un alignement. Le modèle est entrainé sur les données obtenues en comparant un alignement correct (généré à l'aide d'un outil de simulation d'alignement) avec un alignement prédit (généré à l'aide d'un algorithme d'alignement). En utilisant la méthode développée, les … Read more
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2011 — Multi-objective selection and optimization of shaped materials and laminated compositesAbstract
La plupart des méthodes d'optimisation qui existe actuellement pour la fabrication des structures légères sont incapables de générer des structures alternatives au début de la conception. Cette étude cherche à démontrer les difficultés qui existent au début de la conception et propose des solutions en se servant des matériaux conventionnels et des composites laminés.Pour des matériaux conventionnels, la nouvelle méthode de « shape transformers » a été utilisée. Dans cette étude, la méthode traditionnelle a été modifiée et inclus un modèle de rigidité pour la torsion et ainsi généralise cette méthode afin qu'on puisse l'utiliser pour la sélection (simple ou … Read more
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2009 — Aviation and environmental pollution: international attempts for cleaner and quieter skiesAbstract
Le but de cette étude est d'évaluer les différentes solutions proposées au niveau international pour répondre au problème posé par la pollution liée à l'activité aéronautique. L'Organisation de l'Aviation Civile Internationale a préconisé certaines mesures en la matière ; cependant la mise en place et l'exécution de ces normes présentent de nombreuses difficultés.Dans un premier temps, mon étude s'orientera sur la portée de l'application de ces normes sur l'ensemble des règles du droit international public. Puis, je présenterai l'approche choisie par l'Union Européenne (UE) pour résoudre ce problème de pollution engendrée par les activités aéronautiques. Il existe un débat au … Read more
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2012 — Investigation of the energy response of EBT-2 GAFCHROMIC™ film modelAbstract
L'objectif de ce projet est de quantifier la réponse énergétique du film EBT-2 GAFCHROMICTM et d'enquêter sur les compositions chimiques possibles permettant une amélioration de sa réponse énergétique. Dans cette étude, la dépendance énergétique globale du film EBT-2 GAFCHROMICTM est quantifiée en terme de réponse énergétique intrinsèque et de dose absorbée. La réponse énergétique du film en terme de dose absorbée est étudiée par le calcul de la dose à la couche sensible du film et la dose équivalente dans l'eau en utilisant les algorithmes de calcul Monte Carlo DOSRZnrc et EGSnrcMP. Le film a été simulé à l'intérieur d'une … Read more
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1977 — The Waters of the CaroniAbstract
Cette thèse consiste d'un recueil de nouvelles, précédé d’une préface où je trace l’évolution de la société antillaise et plus particulièrement celle du Trinidad, en vue de montrer combien cette société se prête à la création littéraire en général et d’expliquer l'inspiration que j'en ai reçue personnellement. Puis je parte du développement d'une littérature antillaise indigène, des plus importants auteurs qui se sont exprimés en anglaise et de l'influence que j'ai subie d'eux. Toutes les cinq nouvelles du recueil ont comme cadre le village de Hontrose, où je suis né et où j’ai été élevé, et elles sont unies non … Read more
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2021 — Characterizing the quark gluon plasma using soft thermal fluctuations and hard parton interactionsAbstract
Les collisions d’ions lourds effectuées au Grand Collisionneur de Hadrons (LHC) en Europe et au Collisionneur d’Ions Lourds Relativistes (RHIC) aux USA ont pu créer un plasma de quarks et de gluons (QGP). Le QGP est une phase exotique de la matière en interaction forte, où la densité et la température adoptent des valeurs extrêmes. Les propriétés du plasma sont déduites à la suite de comparaisons entre théorie et mesures expérimentales. Les modèles phénoménologiques utilisés pour cette comparaison doivent donc être les plus complets possible. Nous avons étudié les effets de fluctuations thermodynamiques et des interactions de partons énergétiques sur … Read more
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2023 — Mixing measures in turbulent channel flowAbstract
Le mélange de scalaires se produit dans une variété d'écoulements naturels et techniques, dont la grande majorité sont turbulents. La prédiction et le contrôle des concentrations scalaires au sein de ces flux offre des avantages immédiats à de nombreuses applications dans de nombreux domaines. Dans cette mesure, une meilleure compréhension des effets des conditions initiales du champ scalaire sur l'évolution des concentrations scalaires est nécessaire pour favoriser ou retarder la vitesse à laquelle le mélange se produit. Des simulations numériques directes (DNS) sont utilisées pour simuler les champs hydrodynamiques et scalaires puisqu'ils résolvent la gamme complète d'échelles (de longueur et … Read more
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2014 — Factors driving entrainment in flotation systems and implications for bank managementAbstract
L'entraîınement est un mode non-sélective de flottation qui diminue la sélectivité du procédé de flottation. Des études précédentes d´emontrent qu'un profil de récupération balancée (dans laquelle chacune des cellules de flottation dans unesérie a une récupération équivalente) produit la meilleur efficacité de séparation entre deux minerais flottables. Une analyse du modèle empirique JKMRC du débit d'eau à la surverse suggère qu'un profil de récupération massique balancée (dans laquelle chacune des cellules de flottation dans une série a une récupération massique équivalente) minimiserait l'entraînement pour une série de cellules de flottation. Cette conclusion est valide seulement quand la valeur de b … Read more
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2016 — Analysing simple heuristic hiding strategies for non-player characters in gamesAbstract
Le besoin d'un joueur de se cacher des ennemis est une part importante de plusieurs jeux de stratégie et de jeux d'infiltration. Les approches efficaces de dissimulation pour les Personnages Non-Joueurs (PNJ) sont relativement rares, la majorité des jeux n'accordant la capacité de dissumulation qu'aux PNJ ayant un rôle de compagnon, sans regard à leur comportement réel, ou font l'usage de comportements fortement scénarisés.Dans cette thèse nous examinons des approches algorithmiques quant à la furtivité dans le contexte du jeu. Nous explorons de nombreuses stratégies informatiquement simples qui assurent qu'un PNJ puisse se dissimuler d'un observateur en mouvement sur un … Read more
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2017 — Functional extruded products from rice flour, pulse flour and tomato powder blendsAbstract
L'extrusion est un procédé de cisaillement à haute température qui implique un traitement de courte durée dans le but transformer les matières premières en produits intermédiaires ,en produits finis, ou dans le but d'améliorer les propriétés sensorielles et autres qualités des produits finis. La plupart des collations extrudées, préparées à l'aide de mélanges à base d'amidon, sont souvent riches en glucides mais faibles en nutriments essentiels. L'accroissement de la consommation de ces collations aboutie a une augmentation de la demande pour des produits plus sains, dans lesquels l'amidon serait remplacé par des protéines, des fibres et d'autres nutriments. Le but … Read more
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2011 — Antioxidant activity of food proteins and food protein hydrolysatesAbstract
Le but principal de cette recherche constituait l'analyse du potentiel antioxydant, à diverses concentrations, d'hydrolysats de protéine de soya (HPS) et d'hydrolysats de protéine de pois chiche (HPP). Les hydrolysats de protéine ont été isolés à l'aide de l'enzyme protéolytique trypsine. Les HPS et HPP démontraient respectivement un potentiel antioxydant de 16.5 à 32% et 3.4 à 26.8 % lorsque présents à des concentrations de 2.5 à 10 mg/mL. L'utilisation d'une colonne C18 a permis de séparer, par CLHP-PI, les HPS et HPP en quatre fractions (F I, F II, F III, et F IV) qui furent dosées avec du … Read more
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2015 — Transposon-assisted functional genomics of malting quality QTLs in barleyAbstract
L'orge est considéré comme une culture industrielle importante avec le rôle croissant dans l'alimentation, la nourriture et les bio-produits en particulier sous forme de malt pour l'industrie de la distillation et de brassage. Cohérence dans la qualité de malt est l'une des principales composantes de la production de bière. Qualité brassicole de l'orge est un phénotype multiforme, qui combine un grand nombre de composantes interdépendantes liées, dont chacune a un héritage complexe d'empêcher ainsi l'amélioration génétique dans ce trait important. Des études de cartographie génétique identifiée (trait qualitatif loci) plus de 250 de QTL associés à 19 traits de maltage. … Read more
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2017 — Inoculations: the Masques of John HejdukAbstract
Cette thèse de doctorat examinera une série d'oeuvres faite par John Hejduk, quelle il arriva à appeler 'masques'. Meme si quelques éléments des Masques fut construits, ils furent principalement émis en forme de livres, de textes, et d'images de plusieurs genres, qui inclut fréquemment, mais qui ne sont pas limités aux, dessins architecturaux. En tant que publication toute seule, ou en faisant partie d'une compilation, pour Hejduk ces livres constituèrent des oeuvres d'architecture à part entière. La présente étude veut mettre en lumière cette assertion avec une étude compréhensive sur ces projets énigmatiques. Il explore la gamme et la nature … Read more
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2016 — Host-virus interactions: innate immunity in wild-type and drug-resistant HIV-1 infectionsAbstract
Le système immunitaire inné est la première ligne de défense contre le VIH. Le VIH doit se répliquer et se diversifier suffisamment rapidement pour surmonter l'environnement hostile auquel il fait face à l'intérieur de ses cellules immunitaires cibles. L'énorme pression sélective que le système immunitaire applique sur le virus pourrait paradoxalement favoriser certains phénotypes qui permettent la réplication du VIH en dépit des facteurs immunitaires intrinsèques. Les mutations de résistance aux médicaments sont ainsi archivées dans le réservoir et peuvent réapparaître rapidement lorsque les traitements défaillants sont ré-initiées. Il est largement établi que les lymphocytes CD4+ quiescent représentent un réservoir … Read more
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2015 — Integrating maternal mental health into an early child development programAbstract
La dépression est le trouble de santé mentale le plus répandu chez les femmes en âge d’avoir des enfants provenant d’un pays à faible ou moyen revenu. Aussi, 39% des enfants de moins de 5 ans n’atteignent pas leur développement optimal. Chacune de ces problématiques ont été étudiées dans des cadres restreints. Cette thèse s’intéresse au développement, à l’exécution et à l’évaluation d’un programme intégré voulant diminuer la dépression chez les mères et augmenter le développement des enfants dans une population rurale d’Ouganda. L’étude 1 est un essai randomisé du cluster évaluant un programme de 12 sessions sur une intervention … Read more
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2015 — Preparation, characterization, and applications of several optically-switchable azo-polymersAbstract
Cette thèse explore une variété d'application de matériaux photo-actifs basés sur le chromophore azobenzène. Le premier chapitre, l'introduction, présente le contexte et l'information nécessaire à la compréhension des chapitres de recherche. Le second chapitre développe les méthodes expérimentales décrites dans les sections de recherche, en fournissant des détails additionnels qui ne sont pas abordés dans lesdits chapitres. Le troisième chapitre explore les limites fondamentales, sous pression extrême, de l'isomérisation trans-cis, caractéristique de ces molécules. La pression a déjà été mise en cause dans plusieurs applications bien étudiés des polymères fonctionnalisés d'azobenzène: notamment pour la formation de «surface relief grating» résultant … Read more
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2021 — Reinforcement learning in partially observable environments using approximate information stateAbstract
Dans cette thèse, l'apprentissage par renforcement pour les problèmes de prise de décision à plusieurs étapes où le décideur ou l'agent a des observations partielles de l'état est considéré. De nombreux systèmes du monde réel sont partiellement observables---certains exemples sont la conduite autonome, la robotique, les réseaux intelligents, etc. Cependant, la plupart des recherches sur la l'apprentissage par renforcement sont centrées sur des systèmes entièrement observables. Les systèmes partiellement observables sont considérablement plus difficiles que les systèmes entièrement observables parce que la recherche de la politique optimale implique la prise en compte de l'ensemble de la trajectoire des actions et … Read more
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2018 — PmrC and CptA-mediated regulation of outer membrane vesicle production in «Citrobacter rodentium»Abstract
Les vésicules de membrane externe (OMV) sont des structures sphériques produites par toutes les bactéries à Gram négatif. Puisqu'elles dérivent de l'enveloppe des cellules, les OMV contiennent plusieurs protéines périplasmiques, de la membrane externe et lipides qui sont importants dans les interactions hôte-pathogène et inter-bactériennes. Tandis que les fonctions des OMV sont assez bien connues, les mécanismes de la biogénèse des OMV demeurent mal compris. Chez le pathogène murin, Citrobacter rodentium, les transférases de phosphoethanolamine (pEtN), PmrC et CptA, ajoutent le pEtN au lipide A et aux régions du noyau du lipopolysaccharide (LPS) et sont contrôlées par le système à … Read more
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2019 — Hierarchical text classification of large-scale topicsAbstract
La modélisation de sujet et la classification de documents est un problème bien étudié dans la compréhension du langage naturel. Les réseaux de neurones profonds affichent des performances supérieures à celles des classificateurs supervisés traditionnels dans la classification de textes. Ils apprennent à extraire automatiquement des attributs utils lorsqu'une quantité suffisante de données est présentée. Cependant, avec la croissance du nombre de documents vient l'augmentation du nombre de catégories, ce qui entraîne souvent une mauvaise performance des classificateurs à nombreuses catégories. Dans ce travail, nous utilisons l'information donné par la taxonomie de catégorie de sujet pour aider la classification en … Read more
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2023 — Exploring the limits of systematicity of natural language understanding modelsAbstract
Dans cette thèse, nous étudions plusieurs approches pour évaluer les modèles neuronaux de langage modernes à travers le prisme de la systématicité, afin d'évaluer leur raisonnement et leur compréhension du langage naturel à l'échelle humaine. Tout d'abord, nous étudions les limites du modèle dans l'encodage de la sémantique du langage naturel en proposant un jeu de données de défi de diagnostic connu sous le nom de CLUTRR. S'inspirant de la logique du premier ordre, ce jeu de données teste spécifiquement la systématicité de la généralisation des longueurs dans les modèles de compréhension du langage naturel, sous la forme d'une tâche … Read more
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2018 — Simultaneous identification and tracking of a synchronous generatorAbstract
Une nouvelle méthode pour la construction de commande en boucle fermée sans modèle de système est présentée dans cette thèse. La nouvelle méthode est utilisée pour construire un régulateur non linéaire entièrement adaptatif pour un système générateur synchrone. Le but du régulateur est de suivre une trajectoire de sortie de référence donnée. Le système étudié est un système à entrée unique à sortie unique différentiellement plat. La loi de commande de suivi non linéaire exacte est construite en exploitant la platitude du système.L'approche utilise une structure locale de modèle LTI de quatrième ordre qui change avec le temps pour s'adapter … Read more