Comparison of methods to detect resistance of Helminthosporium solani to a thiabendazole fungicide Comparaison de méthodes pour détecter la résistance de Helminthosporium solani au fongicide thiabendazole

Abstract

The development of resistance to a post-harvest and preplanting benzimidazole fungicide, thiabendazole (TBZ), has resulted in the increase of silver scurf of potato caused by Helminthosporium solani. Conventional and polymerase chain reaction (PCR)-based assays were compared, among 54 isolates of H. solani, to detect the TBZ-sensitive (TBZ^S) and -resistant (TBZ^R) isolates. In a PCR-based assay, all 27 single-spore isolates from eastern Canada, nine isolates from Alberta in western Canada, six isolates from North Dakota, USA were distinguished as TBZ^R, the remainder of the isolates being determined as TBZ^S. The results from the PCR-based assay correlated well with the TBZ sensitivity assessment of isolates of H. solani on the TBZ-amended medium. Also, the detection of TBZ^R- H. solani in 20 tuber samples with silver scurf lesions by the PCR-based assay demonstrates that this method can be used to detect the pathogen directly from the tuber lesions. The PCR-based method was more rapid (1 day) than the conventional technique (5 weeks).

Résumé

Le développement de la résistance à un fongicide de benzimidazole, le thiabendazole (TBZ), utilisé après la récolte et avant la plantation, a eu comme conséquence l’augmentation de l’incidence de la tache argentée de la pomme de terre causée par Helminthosporium solani. Des analyses conventionnelles ou basées sur la réaction de polymérisation en chaîne (PCR) ont été comparées pour détecter, parmi 54 isolats de H. solani, les isolats sensibles (TBZ^S) et résistants (TBZ^R) au TBZ. L’analyse basée sur la PCR a déterminé les 27 isolats simples de spores de l’est du Canada, neuf des isolats de l’Alberta (ouest du Canada) et six des isolats du North Dakota (États-Unis) comme TBZ^R, le reste des isolats étant TBZ^S. Les résultats de l'analyse basée sur la PCR ont été bien corrélés avec l’évaluation de la sensibilité au TBZ des isolats de H. solani sur le support avec amendement au TBZ. En outre, la détection de TBZ^R- H. solani dans 20 échantillons de tubercules infectés par la tache argentée par l’analyse basée sur la PCR démontre que cette méthode peut être utilisée dans la détection de l’agent pathogène directement à partir des lésions infectées du tubercule. La méthode basée sur la PCR était plus rapide (1 jour) que la technique conventionnelle (5 semaines).